PIMPINAN UNIVERSITAS
Rektor : Prof. Dr. H. Sirajuddin.M,M.Ag,M.H
Wakil Rektor Bidang Akademik : Drs. H. Zulkarnain. D, M.Pd
Wakil Rektor Bidang Administrasi Umum : Dr. Moh. Dahlan, M.Ag
Wakil Rektor Bidang Kemahasiswaan : Dr. Samsudin, M.Pd
Kepala Biro Administrasi Umum dan Kepegawaian (BAUK) : Dr.Hj. Khairiah, M.Pd
PIMPINAN FAKULTAS
Fakultas Tarbiyah dan Tadris (FTT)
Dekan : Dr. Zubaedi, M.Ag
Wakil Dekan Bidang Akademik : Dr. Irwan Satria, M.Pd
Waki Dekan Bidang Administrasi Umum : Dr. Ali Akbarjono, M.Pd
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan, Alumni dan Kerjasama : Alfauzan Amin, M.Ag
Fakultas Ushuluddin, Adab dan Dakwah (FUAD)
Dekan : Dr. Suhirman, M.Pd
Wakil Dekan Bidang Akademik :
Wakil Dekan Bidang Administrasi Umum : Suryani, M.Ag
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan, Alumni dan Kerjasama :
Fakultas Syari’ah dan Hukum (FSH)
Dekan : Dr. Imam Mahdi, M.Ag
Wakil Dekan Bidang Akademik : Drs. Supardi. M, M.Ag
Wakil Dekan Bidang Administrasi Umum :
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan, Alumni dan Kerjasama : Suwarjin, M.A
Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam (FEBI)
Dekan : Dr. Asnaini, M.Ag
Wakil Dekan Bidang Akademik : Drs. Nurul Hak, M.A
Wakil Dekan Bidang Administrasi Umum : Fatimah Yunus, M.Ag
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan, Alumni dan Kerjasama : Dr. Toha Andiko, M.Ag
Sekolah Pascasarjana (SP)
Direktur : Prof. Dr. Rohimin, M.Ag
Assisten Direktur : Dr. Hery Noer Aly, M.A
Ketua Program Studi PAI Andang Sunarto, Ph.D
Ketua Program Studi Filsafat Agama Dr. Murkilin, M.A
STRUKTUR BIRO ADMINISTRASI UMUM DAN KEPEGAWAIAN (BAUK)
Kepala Bagian Umum : Helvy Mardiatun, S.E
KaSubbag Organisasi & kepegawaian : Muslikhin, S.Ag
Subbagian Tata usaha dan Hukum : Joyo ,S.Ag
Kepala Bagian Publikasi dan Kerjasama Ellyana, S.Ag, M.Pd.I
Kasubag Humas Dok dan Publikasi   Kasubag : Drs. Matsuri
Kerjasama dan Pengembangan Lembaga Dra. Elyawati
Kepala Bagian Perencana Keuangan dan Akuntansi (PKA) : Ahmad Nazir, S.E
Kasubag Keuangan dan Akuntansi : Nekki Lasbefia Antri, S.E
Kasubag Perencanaan dan Akuntansi : Edi Irwansyah, S.Sos
Kepala Bagian Akademik & Kemahasiswaan : Mamah Rahmah, M.M
Kasubbag Data dan Sistem Informasi Akademik : Martini, S.Ag
Kasubbag Pembinaan dan Pemberdayaan Alumni : Nawangsih, M.Si
LEMBAGA
Ketua Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LP2M) : Mus Mulyadi, M.Pd
Kasubbag Tata Usaha LP2M : Imaduddin, S.Ag
Ketua Lembaga Penjaminan Mutu (LPM) : Dr. Aan Supian, M.Ag
Kasubbag Tata Usaha LPM : Ahmad Sulhi, M.Kom
UNIT PELAKSANA TEKNIS (UPT)
Kepala Pusat Perpustakaan : Irfan M.Pd
Kepala Pusat Komputer (Puskom) : Moh. Yusuf, ST
Pusat Bahasa dan Budaya (PBB) : Dr.Riswanto, M.Pd
Kepala Pusat Ma’had al-Jamiah : Drs.Nasron, M.Ag
Kepala Pusat Studi Quran : Ahmad Kanedi, M.Ag